Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hoxd10P28359 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hoxd10P28359 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hoxd10P28359 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxd10P28359 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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