Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Defa3P28310 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms