Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
LoxP28301 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
LoxP28301 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
LoxP28301 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
LoxP28301 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LoxP28301 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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