Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Psmb9P28076 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms