Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms