Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Xrcc5P27641 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Xrcc5P27641 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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