Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gabra3P26049 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms