Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Lmo2P25801 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lmo2P25801 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms