Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccnd1P25322 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnd1P25322 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms