Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cdk11bP24788 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms