Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Htr3aP23979 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms