Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PrkchP23298 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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