Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxb9P20615 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hoxb9P20615 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms