Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Fcer1aP20489 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fcer1aP20489 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms