Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcaP20444 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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