Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou5f1P20263 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou5f1P20263 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms