Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Esr1P19785 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Esr1P19785 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms