Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl13aP19253 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms