Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps6ka3P18654 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms