Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18525 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18525 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18525 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18525 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18525 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18525 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18525 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
P18525 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms