Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Hoxb1P17919 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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Hoxb1P17919 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxb1P17919 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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