Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PcnaP17918 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.5 ms