Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tgfb3P17125 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms