Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ass1P16460 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ass1P16460 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ass1P16460 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ass1P16460 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms