Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Vpreb2P13373 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms