Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
OtcP11725 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
OtcP11725 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
OtcP11725 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
OtcP11725 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
OtcP11725 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms