Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Krt8P11679 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Krt8P11679 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms