Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DmdP11531 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DmdP11531 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DmdP11531 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DmdP11531 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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DmdP11531 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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DmdP11531 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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DmdP11531 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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DmdP11531 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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DmdP11531 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DmdP11531 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms