Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Defa1P11477 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Defa1P11477 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms