Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Parp1P11103 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms