Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Hoxd4P10628 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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