Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nid1P10493 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms