Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
LtaP09225 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
LtaP09225 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtaP09225 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtaP09225 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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