Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc8P09025 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc8P09025 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms