Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Egr1P08046 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms