Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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