Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tk1P04184 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tk1P04184 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms