Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-AaP01910 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-AaP01910 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms