Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01648 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01648 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01648 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01648 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms