Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01641 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01641 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01641 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01641 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01641 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms