Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ifnb1P01575 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ifnb1P01575 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms