Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ComtO88587 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ComtO88587 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ComtO88587 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ComtO88587 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ComtO88587 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ComtO88587 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms