Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dll3O88516 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms