Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Capns1O88456 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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