Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ctnnal1O88327 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ctnnal1O88327 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms