Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Top3aO70157 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Top3aO70157 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Top3aO70157 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Top3aO70157 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Top3aO70157 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3aO70157 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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