Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tlx3O55144 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms