Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dsg2O55111 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms