Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacna1bO55017 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms