Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NmbrO54799 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms